Campuran ini dibiarkan menjalani proses fermentasi selama seminggu atau lebih, hingga bakteri dan ragi membentuk lapisan seperti jamur di permukaan cairan.
Setelah itu, campuran ini dibiarkan beristirahat selama beberapa hari sebelum digunakan. Kombucha dapat disimpan dalam botol tertutup atau kaleng, dan dapat disimpan dalam kulkas atau ruangan dingin.